Het microbioom begrijpen

Het dierlijk microbioom heeft invloed op de diergezondheid. Daarom is het van groot belang om de samenstelling en de mogelijkheid om deze te wijzigen te begrijpen. Natuurlijk kan het alleen worden aangepast als het kan worden gemeten. We kunnen verschillende genomics-analysemethoden toepassen om de samenstelling van het microbioom te onderzoeken of te meten, zoals full-length 16S rRNA-sequencing of shotgun-sequencing.

Een nieuwe methode om het microbioom te karakteriseren is full-length16S rRNA-gensequencing. Met behulp van onze long-read 16S rRNA sequencing workflow kunnen we bacteriën classificeren tot op genus- en species niveau, een veel hogere resolutie dan verkregen met traditionele methoden. Heeft u hulp nodig bij data-analyse en -interpretatie? Op uw verzoek worden data-analyses op maat gemaakt!

Wil je verder gaan dan het identificatieniveau? Een andere nieuwe en baanbrekende methode om het microbioom te begrijpen, is shotgun-sequencing. Long-read sequencing, rechtstreeks uit darm- of andere monsters, maakt de assemblage van metagenomen mogelijk die kunnen worden gebruikt om virulentiefactoren, antimicrobiële resistentiegenen enz. te bestuderen. Dit maakt een meer functionele beoordeling van het microbioom mogelijk.